Rastreamento de objetos#

O que é o rastreamento?#

Rastreamento, ou rastreamento de objetos, refere-se à capacidade de estimar a localização de objetos em movimento de um quadro do vídeo para o próximo. Na prática, o rastreamento de objetos em microscopia envolve a identificação de seus objetos em cada quadro do seu vídeo e, em seguida, relacionam os objetos quadro a quadro para poder identificar a mesma célula à medida que ela se move no espaço.


📏 Como faço para medir?

Existem várias opções para rastrear objetos, como o plugin TrackMate 20 em Fiji, mas o rastreamento é um pouco mais complexo de configurar do que as análises anteriores. Além de apenas identificar objetos no filme/série temporal, o rastreamento também permite identificar eventos de divisão (por exemplo, mitose) e fusão. Existem muitas medições resultantes do rastreamento, incluindo medidas espaciais, como para onde os objetos se movem, medições de velocidade, distância percorrida (comprimento da trilha) e taxa de eventos de divisão (por exemplo, eventos mitóticos) e eventos de fusão.

⚠️ Onde as coisas podem dar errado?
  • segmentação ruim Se os objetos estão saindo de quadro a quadro, isso torna mais difícil rastreá-los ao longo do tempo. A precisão da segmentação é a base de bons resultados de rastreamento. Isso pode se tornar mais difícil se seus objetos também mudarem de forma ou intensidade (devido a efeitos como o fotobranqueamento) ao longo do vídeo. É importante encontrar uma estratégia de segmentação que funcione bem em todo os quadros do video.

  • Taxa de quadros inadequada Se os objetos forem altamente dinâmicos, mas as imagens não forem tiradas em alta frequência, o rastreamento pode ser difícil porque os objetos podem ter se movido demais para que o algoritmo os relacione de um quadro para o outro. É importante combinar a frequência de aquisição da imagem com a dinâmica de suas células ou objetos.

📚🤷‍♀️ Onde posso aprender mais?