Bioimagem Quantitativa#

O que queremos dizer com bioimagem quantitativa?#

Embora a microscopia tenha sido necessariamente uma ciência qualitativa durante a maior parte de sua história, agora vivemos em uma era em que as imagens do microscópio podem ser usadas para quantificar com precisão os fenótipos observáveis.

A capacidade de extrair respostas quantitativas precisas desses experimentos depende do cumprimento de certas práticas recomendadas. Se alguém puder dizer «sim» com confiança para cada uma das 4 perguntas a seguir, é provável que seja capaz de quantificar sua amostra.

  • Eu preparei minha amostra de forma a minimizar os artefatos técnicos e me permitir entender exatamente qual(is) molécula(s) estou observando?

  • Realizei minha microscopia de modo a minimizar os artefatos técnicos e estou na faixa quantitativa do detector conectado ao meu microscópio?

  • Selecionei métricas de análise que realmente respondem à minha pergunta biológica e as medi de forma a minimizar artefatos técnicos?

  • Eu escolhi comparações estatísticas apropriadas e abordagens de apresentação de dados para que a distribuição de minha(s) métrica(s) possa(m) ser comparada(s) de forma justa entre as amostras, respondendo à minha pergunta biológica?

Responder a cada uma dessas perguntas requer reflexão, experiência e, muitas vezes, uma quantidade razoável de tentativa e erro; pode parecer intimidador lidar com todos os aspectos técnicos e ressalvas presentes em um experimento de bioimagem. Essas perguntas podem ser respondidas, embora muitas vezes não de primeira - uma contínua otimização por meio de várias rodadas de respostas a essas perguntas geralmente é necessária para obter melhores resultados.

Os recursos vinculados neste guia são projetados para ajudar o leitor a desenvolver habilidades em cada uma ou em todas essas áreas, ajudando-o a obter o máximo de seus dados de microscopia.

ciclo

Fig. 2 O ciclo de decisão da bioimagem quantitativa 2 Reproduzido de Senft e Diaz-Rohrer et al, [Guia de um biólogo para planejar e realizar experimentos de bioimagem quantitativa](https://doi.org /10.1371/journal.pbio.3002167).#