Software de Uso Específico#
As ferramentas nesta página tendem a ser extremamente boas em determinadas tarefas, mas são menos destinadas a usos mais comuns. Para ferramentas com áreas de foco mais amplas, consulte a página Software de uso geral.
Cellpose#
Cellpose 35 é um algoritmo de segmentação, que fornece uma interface gráfica do usuário em que permite aos usuários usar modelos treinados ou treinar seus próprios usando suas imagens e anotações.
Em que tipo de problema de análise de imagem este software é melhor?
Segmentação de objeto, a maioria dos modelos treinados são para a segmentação de células, mas podem ser aplicados para segmentar outros objetos semelhantes
Quais são suas desvantagens?
A sua utilização requer algum conhecimento computacional.
Treinar um novo modelo requer correção da anotação manual que pode ser demorada, mas provavelmente consome menos tempo do que outros métodos de treinamento.
Como baixar/instalar e saber mais?
ilastik#
ilastik 36 é uma ferramenta para classificação interativa de imagens, segmentação e análise. Ele aproveita os algoritmos de aprendizado de máquina para executar a classificação em nível de pixel e objeto. Usá-lo não requer experiência em processamento de imagem.
Em que tipo de problema de análise de imagem este software é melhor?
Ele pode ser usado tanto para a segmentação em instancia quanto para a segmentação semântica. Ele também executa segmentação e rastreamento, embora com um pouco menos de parâmetros ajustáveis do que algumas outras ferramentas disponíveis.
Quais são suas desvantagens?
Às vezes, carregar ou exportar imagens pode exigir um pouco de paciência para obter as dimensões corretas.
O ilastik é limitado pela RAM do seu computador, portanto, treinar um modelo com muitos recursos ou trabalhar com imagens muito grandes provavelmente o deixará lento.
Como baixar/instalar e saber mais?
Para baixar o ilastik:
Para documentação, exemplos e tutoriais.
Piximi#
Piximi é um aplicativo para anotação e classificação que é executado inteiramente no seu navegador e não requer instalação e configuração mínima.
Em que tipo de problema de análise de imagem este software é melhor?
Piximi pode fazer classificação de imagens usando aprendizado de máquina
Quais são suas desvantagens?
Ainda está em fase de desenvolvimento e alguns dos recursos propostos ainda não estão disponíveis