Bem-vindo#
Bem-vindo ao mundo da bioimagem e análise de bioimagem! 🎉
Fig. 1 Montagem de imagens de microscopia de fluorescência do BBBC 1 (Broad Institute). As imagens mostradas são dos experimentos BBBC007, BBBC008, BBBC034, BBBC038, BBBC039 , e BBBC020 da esquerda para a direita, de cima para baixo.#
O que este livro é?#
Este livro é um site complementar ao nosso artigo «Guia de um biólogo para planejar e realizar experimentos de bioimagem quantitativa» 2 . Nosso objetivo é fornecer recomendações e um conjunto de recursos selecionados para biólogos que procuram entender os fatores que afetam seus experimentos de microscopia de fluorescência.
Este livro é um esforço colaborativo de especialistas em biologia, geradores de imagens, análisistas de imagens e gerenciamento, interpretação e apresentação de dados. Nossas dicas e recomendações vêm de experiências reais de treinamento e trabalho com biólogos iniciantes em bioimagem e análise de bioimagem. Ao começar em um novo campo, muitas vezes você não sabe o que não sabe. Aqui fornecemos contexto, dicas para evitar erros comuns de iniciantes e uma lista focada de recursos de código aberto de alta qualidade (lista completa disponível [aqui] (bibliografia)). Usamos ícones para indicar o tipo de recurso:
Icon |
Resource type |
|---|---|
📖 |
Textbook (free online) |
📄 |
Scientific paper |
💻 |
Software or software notes |
🌐 |
Website |
🎓 |
Lecture notes or slides |
🎥 |
Video |
🔢 |
Math-heavy theory |
O que este livro não é?#
Este livro não pretende ser uma lista exaustiva de todos os recursos. Muitos outros selecionaram excelentes recursos (consulte aqui 3 e [aqui](https://www. bioimagingnorthamerica.org/training-education-resources/) e aqui 4). Nosso objetivo é criar um guia mais simplificado e acessível para iniciantes.
Este livro não é um protocolo ou guia passo a passo, embora alguns recursos aos quais nos vinculamos possam ser. Cada subseção, desde a preparação da amostra até a interpretação dos dados, são tópicos enormes que não podemos abordar exaustivamente em um guia para iniciantes.
Como usar este livro:#
Selecione uma seção usando o painel de navegação à esquerda para começar ou comece com a preparação da amostra clicando no botão «Avançar» abaixo ↘️.
A maioria das seções irá guiá-lo através de subtópicos individuais usando algumas ou todas as seguintes listas de perguntas:
O que é?
Quais são minhas opções?
Como eu faço isso?
Onde as coisas podem dar errado?
Onde posso aprender mais? (links para recursos)
Quais perguntas são usadas e a frase exata pode variar de acordo com a seção, mas esperamos que essa estrutura ajude a guiar os usuários a uma compreensão mais profunda de cada subtópico.
E se meu recurso/tópico não estiver incluído?#
Sinta-se à vontade para abrir um problema ou solicitar uma contribuição! Esperamos que este seja um documento vivo que reflita as melhores práticas e recursos disponíveis.